W naszych urządzeniach przechowujemy często istotne dla nas dane, takie jak hasła do kont internetowych, numery PIN i inne poufne informacje. Niestety nie każdy korzysta z odpowiednich programów do zabezpieczania tych danych, a nawet jeśli mamy zainstalowaną aplikację z kategorii elektronicznych portfeli, to trzeba zdawać sobie sprawę, że nie ma zabezpieczenia, którego nie dałoby się złamać. Dlatego też wiele osób obawia się o bezpieczeństwo przechowywanych w PDA danych, w wypadku np. kradzieży urządzenia. Niektóre palmtopy HP posiadają sprytne zabezpieczenie, polegające na tym, że gdy hasło dostępu do PDA zostanie kilka razy źle wprowadzone, to może on automatycznie wykonać twardy reset. Innym ciekawym sposobem na ochronę danych - tym razem w urządzeniach Phone Edition, jest program PDAKill.