Na obydwu używam CM, więc software'owo praktycznie to samo. Na Nexusie CyanogeMod jest troszkę bardziej dopracowany.
Przewaga nad Nexusem to ekran (jednak lubię AMOLEDy), karta microSD, czulsze radio GSM i lepszy zasięg, no i przede wszystkim aparat o klasę lepszy.
Wydajność też na plus, taki Asphalt 8 działa wyraźnie lepiej na S4.