Należy ustawic palmtopa w niewielkiej odległości od komputera PC (do 0.5 metra), w ten sposób by porty podczerwieni obu urządzeń widziały się w prostej linii i by nic nie blokowało sygnału.
Następnie udajemy się do ustawień pecetowej aplikacji ActiveSync:
- w przypadku wersji 3.x -> Menu File -> Connection Settings -> Allow serial cable or infrared connection to this com port, gdzie wybieramy Infrared Port (lub odpowiadający mu numer portu COM).
- dla ActiveSync w wersji 4.x -> Menu File -> Connection Settings -> Allow connections to one of the following -> wybieramy port podczerwieni.
Teraz pozostaje już tylko kliknąć połącz w palmtopie i gotowe. W systemie Pocket PC 2000 w Menu Connections znajduje się ikonka IR Sync, natomiast w Pocket PC 2002 lub Windows Mobile 2003 for Pocket PC i nowszych okienkach, opcja ta została ukryta w aplikacji ActiveSync -> Tools -> Connect via IR.