Dziwne, ostatnio trochę eksperymentowałem z formatowaniem SD pod Linuksem i PPC zawsze kartę widział. Nawet zrobiłem 2 partycje na karcie 1GB i PPC zobaczył obie. Windows z drugą miał problemy :-)
Podaj jakieś szczegóły, typu sprzęt, system, użyte programy, parametry formatowania, objawy złego działani itd. Może ktoś zgadnie, co robisz źle.
Albo spróbuj sformatować kartę w aparacie fotograficznym :-)