Wydaje mi się kolego, że to nie kwestia CSMI ale Twojego ROMu i wgotowanych w niego programów. U mnie CMSi widzi dokładnie wszystko, co jest w StartMenu. Jest i HTC Messaging, i Aparat/ Kamera, i Flashlight...
Możesz jeszcze spróbować
TEGO.
Zanim pojawiły się powyższe programy używałem też SK Shortcut Manager, ale z nim jest kupa grzebania, bo ikony trzeba najpierw przerabiać na .ico, potem wrzucać do plików .dll... ogólnie wygodne jak odbyt na łokciu

Jest też ręczna metoda zmian ikon, bez żadnego programu, samą edycją rejestru, opisana ładnie
TUTAJ.