Ja jeszcze na oczy nie widziałem pytania gdzie program ma się wgrać (ale trzeba rozróżnić wgranie od trzymania swoich danych, bo pytania o to drugie są częstym zjawiskiem).
Pamiętam, że chyba jeszcze w CM 7.x była opcja gdzie domyślnie mają być instalowane aplikacje, ale od ICSa już jej nie ma. Zostaje tylko mechanizm wbudowany w Androida lub SD-EXT. Z rootem można z tego co wiem jedynie wymusić przeniesienie systemowym sposobem aplikacji, których oficjalnie się nie da. Ale to skończy się niedziałającymi widżetami, itd. Żeby wszystko ładnie działało potrzebny jest już SD-EXT.