W starszych wersjach deinstalację robiło się z poziomu PC tym samym programem którym instalowałeś Automapę (była tam opcja odinstaluj).
Możesz spróbować odinstalować i zainstalować ją ponownie - ja wersji 3.9 niestety nie instalowałem, zrezygnowałem po zapoznaniu się z szeregiem, nie do końca pochlebnych, opini na forum. Wiem, że 3.9 na pewno potrzebuje więcej ramu niż starsze wersje.
Mnie nie zależy tak bardzo na najnowszych wersjach map bo używam nawigacji może 2 razy w roku, ale jeśli potrzebujesz najnowsze mapy to nie ma wyjścia i pozostaje wersja 3.9. Poszukaj na forum bo było tu sporo dyskusji na temat, która z wersji 3.9.x działa najstabilniej.