To chyba oczywiste, że GSM nie ma nic do tego. Akurat Fire Red i jeszcze jakaś część bodajże nie wymagały tego.
Po tych dwóch komunikatach gra powinna nadal działać... Natomiast kiedyś były patche do poków (możliwe, że chodziło właśnie o RTC, ponieważ niektóre programatory do GBA też RTC nie obsługiwały), lecz czy one akurat to łatały? Tego już nie pamiętam...
Faktycznie dobrze by było, jakbyś sprostował, którą wersję posiadasz.
Poszukaj czy są patche do Twojej wersji i zaaplikuj je programem gbata.