Wirusów na PDA może nie ma jeszcze zbyt wiele, ale na rynku dostępnych jest już kilka aplikacji do ich zwalczania. Jednym z bardziej popularnych programów tego typu jest AirScanner AntiVirus. Ostatnio udostępniono nową jego wersję (3.0) oferującą poza odświeżonym interfejsem graficznym również opcję ciągłego monitoringu systemu, ulepszony menadżer zadań ułatwiający ubijanie wrogich aplikacji, rozbudowany system planowania automatycznych aktualizacji i skanowania oraz mniejsze zapotrzebowanie na czas procesora oraz ilość pamięci operacyjnej.