W WM6 nie musisz nic ustawiać, tylko dociągnać aktualizację.  Natomiast w Automapie wchodzisz do ustawień GPS i wybierasz port COM7 - przynajmniej u mnie w X500+ jest to COM7 - oznaczony jako "AGPS".
Z moich obserwacji natomiast wynika, że ustawianie portu na COM7 wcale nie jest konieczne w większości przypadków.  Istotą AGPS jest to, że moduł GPS posiada wstępne efemerydy czyli informacje o położeniu satelitów już na starcie i nie musi dociągać ich z jednego z nich, co trwa te co najmniej kilkadziesiąt sekund.  To wystarcza, żeby szybciej łapać fiksa.  Np. w Ozim, jeśli próbujesz złapać pozycję po co najmniej czterogodzinnej przerwie (czas ważności efemeryd ściąganych standardowo z satelity) i masz aktualizację - to niezależnie od wybranego portu system od razu widzi najbliższe satelity i próbuje złapać ich sygnał.  Jeśli nie masz aktualizacji - numerki będą pojawiać się po kolei i cały proces będzie trwał dłużej.  Zaletą aktualizacji jest ich dłuższy termin ważności - 3 do 7 dni.
A dwa osobne porty są dlatego, że po COM7 przesyłane są dodatkowe informacje, które nie wszystkie programy potrafią wykorzystać i które wtedy niepotrzebnie opóźniają wartościowe pakiety NMEA.  Szczerze mówiąc, wątpię, czy Ozi albo Automapa tak naprawdę wykorzystują te dodatkowe informacje.  Ale kto ich tam wie.